Horaire : 16h-17h - Langue : anglais
Nous avons le plaisir de vous inviter à une nouvelle session de notre série de webinaires consacrés à la génomique des pathogènes, dédiée au domaine en pleine évolution du séquençage long-read et à son impact sur la détection et la caractérisation des agents pathogènes.
Ce webinaire réunira trois intervenants experts qui partageront des perspectives de pointe issues de leurs travaux de recherche.
Daniel Golparian, Centre collaborateur de l’OMS pour la gonorrhée et autres IST, Örebro, Suède
Daniel Golparian est chargé de recherche spécialisé dans la surveillance génomique, la résistance aux antimicrobiens et le séquençage du génome entier des agents pathogènes sexuellement transmissibles. Ses travaux font le lien entre les approches expérimentales (wet lab) et la bioinformatique, avec un fort accent sur la mise en œuvre de flux de travail de séquençage dans des contextes de santé publique.
Sa présentation, « Permettre le séquençage du génome entier sans culture grâce à Agilent SureSelect et au système NGS Magnis », mettra en lumière :
• L’utilisation du NGS Magnis pour automatiser les enrichissements de cibles
• Des stratégies permettant de séquencer directement à partir d’échantillons sans culture
• La manière dont l’automatisation améliore la reproductibilité, la scalabilité et l’implémentation de la génomique pour l’étude des agents pathogènes responsables des IST
Lorenzo Piermatteo et Stefano d’Anna, Université de Rome Tor Vergata, Italie
Lorenzo Piermatteo, en collaboration avec Stefano D’Anna, présentera des résultats majeurs montrant comment le séquençage long-read permet de révéler une intégration étendue de l’ADN du VHB, contribuant à une forte production d’HBsAg et au maintien de la persistance du VHD.
Points clés de cette étude :
• La dépendance du VHD vis-à-vis de l’HBsAg produit à partir de l’ADN ccc et de l’ADN du VHB intégré
• L’analyse de tissus hépatiques issus d’échantillons VHD positifs et HBeAg négatifs
• La caractérisation des intégrations du VHB à l’aide du séquençage long & short-read ainsi que du RNA-Seq
• Des preuves montrant que la co-infection par le VHD est associée à un réservoir de VHB réduit mais à une production persistante d’HBsAg induite par les intégrations du VHB
Pourquoi participer ?
1. S’informer sur les avancées rapides en génomique des agents pathogènes
Les technologies de séquençage évoluent rapidement. Cette session offre une vue d’ensemble accessible des nouvelles approches qui façonnent l’avenir de la recherche sur les maladies infectieuses.
2. Découvrir des approches pratiques applicables à différents types d’agents pathogènes
Que vous travailliez sur des bactéries, des virus ou des échantillons complexes, vous acquerrez des connaissances applicables sur les workflows de séquençage, les stratégies d’enrichissement et l’interprétation des données.
3. Découvrir des exemples concrets issus de la recherche
Nos intervenants partageront des études de cas illustrant comment les outils de séquençage modernes permettent de mieux comprendre les mécanismes biologiques et d’appuyer la prise de décision.
4. Idéal pour tous les professionnels impliqués dans la recherche sur les maladies infectieuses, la génomique ou les projets moléculaires
Ce webinaire s’adresse aux chercheurs, scientifiques de laboratoire et professionnels de santé publique souhaitant approfondir leur compréhension de l’analyse des agents pathogènes basée sur le séquençage.
